Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 RNU2-72P-201ENST00000411175 163 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PDK4Q16654 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PDK4Q16654 AL590103.1-201ENST00000434488 307 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PDK4Q16654 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PDK4Q16654 AL096678.1-201ENST00000438877 472 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PDK4Q16654 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PDK4Q16654 AC096558.1-202ENST00000442794 561 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PDK4Q16654 AL096829.2-201ENST00000446582 742 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PDK4Q16654 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PDK4Q16654 FO393408.1-201ENST00000458577 582 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PDK4Q16654 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PDK4Q16654 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PDK4Q16654 RPL23AP44-201ENST00000482216 473 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PDK4Q16654 AC008696.2-201ENST00000503323 825 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PDK4Q16654 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PDK4Q16654 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PDK4Q16654 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
PDK4Q16654 AP001205.1-201ENST00000521625 449 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PDK4Q16654 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PDK4Q16654 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PDK4Q16654 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PDK4Q16654 AC006518.2-201ENST00000542513 940 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PDK4Q16654 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PDK4Q16654 AL136520.1-202ENST00000555494 763 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PDK4Q16654 LINC00871-202ENST00000556071 554 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PDK4Q16654 AC068875.1-201ENST00000561054 463 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PDK4Q16654 AC090618.1-201ENST00000571972 585 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PDK4Q16654 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PDK4Q16654 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PDK4Q16654 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PDK4Q16654 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PDK4Q16654 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PDK4Q16654 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PDK4Q16654 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PDK4Q16654 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PDK4Q16654 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PDK4Q16654 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
PDK4Q16654 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PDK4Q16654 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC3.46□□□□□ -1.85
PDK4Q16654 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC3.46□□□□□ -1.85
PDK4Q16654 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
PDK4Q16654 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PDK4Q16654 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PDK4Q16654 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
PDK4Q16654 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PDK4Q16654 Y_RNA.110-201ENST00000363220 99 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PDK4Q16654 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PDK4Q16654 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PDK4Q16654 RNU6-468P-201ENST00000384003 109 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PDK4Q16654 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PDK4Q16654 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PDK4Q16654 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PDK4Q16654 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PDK4Q16654 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PDK4Q16654 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PDK4Q16654 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PDK4Q16654 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PDK4Q16654 AL049610.1-201ENST00000423374 372 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PDK4Q16654 AL512637.2-201ENST00000431287 1256 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PDK4Q16654 LINC01598-201ENST00000432067 460 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PDK4Q16654 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PDK4Q16654 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PDK4Q16654 AL592437.1-201ENST00000443781 492 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PDK4Q16654 SEPT14P24-201ENST00000447236 180 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PDK4Q16654 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PDK4Q16654 AC108078.3-201ENST00000502633 489 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PDK4Q16654 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PDK4Q16654 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PDK4Q16654 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PDK4Q16654 TBCA-206ENST00000518338 551 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PDK4Q16654 AC025524.2-211ENST00000519990 1173 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
PDK4Q16654 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PDK4Q16654 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
PDK4Q16654 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PDK4Q16654 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PDK4Q16654 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PDK4Q16654 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PDK4Q16654 AC078880.5-201ENST00000617845 421 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PDK4Q16654 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PDK4Q16654 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PDK4Q16654 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PDK4Q16654 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
PDK4Q16654 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PDK4Q16654 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
PDK4Q16654 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
PDK4Q16654 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
PDK4Q16654 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
PDK4Q16654 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PDK4Q16654 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PDK4Q16654 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PDK4Q16654 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PDK4Q16654 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PDK4Q16654 SFR1P2-201ENST00000421841 730 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PDK4Q16654 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PDK4Q16654 KCTD10P1-201ENST00000434203 625 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PDK4Q16654 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PDK4Q16654 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PDK4Q16654 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PDK4Q16654 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PDK4Q16654 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.1 ms