Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 AC018682.2-201ENST00000517716 399 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CHD4Q14839 OR4R2P-201ENST00000530815 597 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CHD4Q14839 RFPL1S-203ENST00000539579 330 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CHD4Q14839 AL136298.1-201ENST00000557371 566 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CHD4Q14839 AP005433.1-201ENST00000582939 620 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CHD4Q14839 BMS1P7-201ENST00000602440 1052 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CHD4Q14839 STATH-208ENST00000615994 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CHD4Q14839 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CHD4Q14839 CYP3A43-203ENST00000342499 1396 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CHD4Q14839 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
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CHD4Q14839 RPS7P13-201ENST00000413955 498 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CHD4Q14839 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CHD4Q14839 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CHD4Q14839 AL451164.2-201ENST00000445932 597 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CHD4Q14839 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CHD4Q14839 AL023581.2-201ENST00000454588 552 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CHD4Q14839 PDCL2P2-201ENST00000533651 189 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CHD4Q14839 AC110023.1-201ENST00000554318 457 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CHD4Q14839 AC233266.2-201ENST00000567067 528 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CHD4Q14839 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CHD4Q14839 AC093227.3-202ENST00000586606 704 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CHD4Q14839 AC092474.3-201ENST00000603022 568 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CHD4Q14839 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CHD4Q14839 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CHD4Q14839 MIR325HG-208ENST00000630388 1043 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CHD4Q14839 AC074099.1-201ENST00000634100 679 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CHD4Q14839 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CHD4Q14839 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CHD4Q14839 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CHD4Q14839 DCAF13P3-201ENST00000561147 1334 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CHD4Q14839 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CHD4Q14839 MEI4-201ENST00000602452 4800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CHD4Q14839 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CHD4Q14839 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CHD4Q14839 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CHD4Q14839 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
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CHD4Q14839 MTND4LP7-201ENST00000431728 294 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CHD4Q14839 AL450263.2-201ENST00000439400 589 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
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CHD4Q14839 AC093311.1-201ENST00000506586 2021 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CHD4Q14839 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CHD4Q14839 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CHD4Q14839 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CHD4Q14839 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
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CHD4Q14839 STARD13-AS-208ENST00000589472 859 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
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CHD4Q14839 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CHD4Q14839 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CHD4Q14839 AC092159.4-201ENST00000624944 550 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CHD4Q14839 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CHD4Q14839 MTCO1P4-201ENST00000520516 1409 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CHD4Q14839 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CHD4Q14839 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CHD4Q14839 MIR421-201ENST00000365696 85 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CHD4Q14839 DNAH14-203ENST00000366848 929 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CHD4Q14839 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CHD4Q14839 CD84-205ENST00000368051 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CHD4Q14839 CXorf66-201ENST00000370540 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CHD4Q14839 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CHD4Q14839 CCNB2P1-201ENST00000399411 1150 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CHD4Q14839 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CHD4Q14839 LINC01473-202ENST00000427108 695 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CHD4Q14839 AL353718.1-201ENST00000451028 517 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CHD4Q14839 AC026347.1-201ENST00000463255 474 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CHD4Q14839 AC090543.1-201ENST00000492168 485 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CHD4Q14839 ZCCHC10-207ENST00000509437 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CHD4Q14839 C11orf65-206ENST00000529391 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CHD4Q14839 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
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