Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 EIF4A1P6-201ENST00000448133 1210 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 RPL31P15-201ENST00000449770 338 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AC104634.1-201ENST00000452720 462 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AL354710.1-201ENST00000453641 246 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 APOOP2-201ENST00000461561 539 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 RN7SL515P-201ENST00000463999 297 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AC058823.1-201ENST00000485315 474 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AC093267.1-201ENST00000489176 961 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AC083800.1-201ENST00000490594 246 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AC079226.2-201ENST00000509283 518 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 NPM1P41-201ENST00000512920 831 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AC011389.1-203ENST00000513790 573 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 RPL26L1-203ENST00000519239 679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 PSMA6P4-201ENST00000603247 718 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AC245041.2-202ENST00000613389 493 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 OR10K1-203ENST00000641432 3775 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AC009313.2-201ENST00000417893 1941 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 GRAMD2B-210ENST00000511134 1577 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 CFHR3-205ENST00000471440 1965 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 CLCA3P-201ENST00000284054 2407 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 PPP2R2A-201ENST00000315985 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 MIR1282-201ENST00000408865 101 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AC092634.4-201ENST00000419937 423 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AC023590.1-205ENST00000430457 676 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 RPS29P14-201ENST00000431518 171 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AC012075.1-201ENST00000436549 580 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 FHP1-201ENST00000442741 703 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 LINC00704-202ENST00000443994 418 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AL161636.2-201ENST00000445179 927 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AC096543.1-201ENST00000455038 823 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AC063943.1-201ENST00000465434 453 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AC100832.1-201ENST00000471945 383 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 RPL7P39-201ENST00000481157 744 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TOP3AQ13472 LINC02200-202ENST00000508879 615 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.5 ms