Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
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MKRN4PQ13434 SH3D19-203ENST00000409598 5284 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
MKRN4PQ13434 PPP1R12B-216ENST00000608999 15248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
MKRN4PQ13434 ZNF138-206ENST00000440598 2230 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
MKRN4PQ13434 RDH11-203ENST00000553384 1926 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
MKRN4PQ13434 KDM4C-215ENST00000543771 3332 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
MKRN4PQ13434 ARNT-201ENST00000354396 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
MKRN4PQ13434 CDH12-201ENST00000382254 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
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MKRN4PQ13434 CD109-203ENST00000437994 9401 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
MKRN4PQ13434 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
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MKRN4PQ13434 ANKRD30A-205ENST00000611781 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
MKRN4PQ13434 AP003119.3-201ENST00000566747 4192 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
MKRN4PQ13434 HYDIN-206ENST00000393567 15719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
MKRN4PQ13434 PLEKHA1-204ENST00000392799 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
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MKRN4PQ13434 AC097478.1-207ENST00000612706 2422 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
MKRN4PQ13434 FAM96B-201ENST00000422424 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
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MKRN4PQ13434 AL669831.5-205ENST00000429505 441 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
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MKRN4PQ13434 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
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MKRN4PQ13434 AC002368.1-201ENST00000456981 388 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
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MKRN4PQ13434 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
MKRN4PQ13434 AL121809.2-201ENST00000613169 341 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
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MKRN4PQ13434 EFCAB8-204ENST00000618684 435 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
MKRN4PQ13434 AL627309.5-201ENST00000484859 4860 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
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MKRN4PQ13434 FBXW10-201ENST00000301938 3221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
MKRN4PQ13434 ACO1-201ENST00000309951 7466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
MKRN4PQ13434 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
MKRN4PQ13434 TMEM246-203ENST00000374851 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
MKRN4PQ13434 CD163-202ENST00000396620 3800 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.13
MKRN4PQ13434 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
MKRN4PQ13434 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
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