Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 RPL31-204ENST00000409038 817 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 AL159174.1-202ENST00000425588 442 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 AL161912.1-201ENST00000448475 524 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 LINC02492-204ENST00000515660 584 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 TMEM68-206ENST00000519784 1009 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 RGS4-207ENST00000527809 817 ntTSL 4 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 MFAP5-212ENST00000543369 972 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 AL512347.1-201ENST00000566420 503 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 AC010680.3-201ENST00000604215 520 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 AL031666.3-201ENST00000609320 1006 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 AC019278.1-201ENST00000623516 479 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 LINC02471-203ENST00000641941 4752 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 GPX8-203ENST00000503787 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 TPTE2-201ENST00000255310 1562 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 OTUD6B-202ENST00000404789 1089 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 MIR1911-201ENST00000410783 80 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 RPS26P40-201ENST00000435209 294 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 RPS3AP54-201ENST00000435535 734 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 FABP3P2-201ENST00000453169 399 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 ARPC3P2-201ENST00000457786 533 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 MTCO1P30-201ENST00000515244 580 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 PHBP17-201ENST00000528576 541 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 AL109766.1-201ENST00000555080 552 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 AL360157.1-201ENST00000565962 87 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 AC024267.4-202ENST00000582631 436 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 AC090506.1-201ENST00000583089 572 ntTSL 4 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 AC020914.6-201ENST00000594327 272 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 DTNA-232ENST00000599844 853 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 CEACAM7-204ENST00000602225 524 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 AL590235.2-201ENST00000602641 632 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
SNTA1Q13424 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
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