Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 AL591441.1-201ENST00000618108 2247 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 REV3L-IT1-201ENST00000411895 382 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 AL050321.1-201ENST00000432363 400 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 AC096638.2-201ENST00000434965 711 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 RNF148-202ENST00000447240 839 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 LINC00393-202ENST00000452852 485 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 ANK3-207ENST00000460468 677 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 RPL23AP44-201ENST00000482216 473 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 AC105031.3-201ENST00000524359 616 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 OR8K4P-201ENST00000534608 872 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 AC073864.1-201ENST00000540161 562 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 AC135050.5-201ENST00000576336 543 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 CCDC58P3-201ENST00000590792 430 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 AC092106.3-201ENST00000611308 722 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 AC024257.5-201ENST00000612739 531 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 AC024560.2-201ENST00000507981 1497 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 ANAPC10P1-201ENST00000395991 556 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 CLK1-203ENST00000409769 1192 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 AP001599.1-201ENST00000426771 361 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 Z74696.2-201ENST00000436514 498 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 AC064874.1-202ENST00000440101 287 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 AL360089.1-201ENST00000442260 436 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 AC093157.1-204ENST00000454721 753 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 AL133477.1-201ENST00000457472 514 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 NIPA2P2-201ENST00000496376 1083 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 AC108941.1-201ENST00000502853 530 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 AC091951.3-201ENST00000504093 246 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 AC116616.1-201ENST00000508815 366 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 RNU6-311P-201ENST00000516224 102 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 LINC00534-201ENST00000517400 793 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 AP003472.1-201ENST00000519844 644 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 NAT2-202ENST00000520116 716 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 AC011853.2-201ENST00000526901 774 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 AC073530.1-201ENST00000535917 775 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SGCGQ13326 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
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