Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AC112715.1-201ENST00000445534 350 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AC078883.3-201ENST00000458314 512 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 RNA5SP73-201ENST00000516744 108 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AC105233.3-201ENST00000531125 744 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AC107958.2-201ENST00000555396 592 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AL390964.1-201ENST00000622486 845 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 OSBPL6-201ENST00000190611 10513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 C12orf50-203ENST00000550553 1525 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 OR8G1-201ENST00000341493 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 MFAP5-202ENST00000396549 1195 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 ATP5F1P4-201ENST00000397288 746 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 SRGAP3-AS1-201ENST00000414633 428 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 RPL22P18-201ENST00000417197 377 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AL359878.2-201ENST00000435531 407 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 TPTE2P3-201ENST00000441562 1189 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 FABP3P2-201ENST00000453169 399 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 LINC00973-201ENST00000473756 962 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AC106872.2-201ENST00000494303 480 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AC093297.2-204ENST00000508945 295 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AC108064.1-201ENST00000513791 460 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 RNU5A-4P-201ENST00000516588 111 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AC106028.2-201ENST00000555325 464 ntTSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 Z98200.1-201ENST00000607298 470 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 GAB1-203ENST00000505913 2477 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 PTAR1-202ENST00000377200 9876 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 NPFFR2-203ENST00000358749 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 S100A10-201ENST00000368809 616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 RN7SKP33-201ENST00000410942 340 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CHAF1BQ13112 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.3 ms