Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC2.59□□□□□ -2
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CHD3Q12873 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC2.59□□□□□ -2
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CHD3Q12873 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC2.59□□□□□ -2
CHD3Q12873 AC023202.1-201ENST00000521681 491 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -2
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CHD3Q12873 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -2
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CHD3Q12873 RPS27P5-201ENST00000444247 244 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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CHD3Q12873 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
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CHD3Q12873 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
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CHD3Q12873 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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CHD3Q12873 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
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