Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 AC024132.3-201ENST00000513616 649 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 TMEM68-206ENST00000519784 1009 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AC027309.2-201ENST00000520566 192 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AC025437.3-201ENST00000523178 771 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 IFNG-AS1-201ENST00000536914 494 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 LINC02294-201ENST00000549330 497 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 LINC02277-201ENST00000553386 453 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AC006504.2-201ENST00000589471 458 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AC008946.1-201ENST00000599756 421 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 PRKCQ-AS1-207ENST00000607996 531 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 STARD13-AS-235ENST00000609335 855 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AL356515.1-201ENST00000611081 415 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AC022509.4-201ENST00000621404 572 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 LINC00690-201ENST00000429949 1365 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 CSN1S1-201ENST00000246891 985 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AL390774.2-201ENST00000423942 788 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 LINC00382-201ENST00000427918 890 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AL359878.2-201ENST00000435531 407 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AC010890.1-201ENST00000454699 469 ntTSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 ANK3-207ENST00000460468 677 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 RPL5P24-201ENST00000463742 885 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AC091212.1-201ENST00000474798 395 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AC022784.3-202ENST00000517816 826 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 RGS5-218ENST00000526176 574 ntTSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AP000926.4-201ENST00000527351 454 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 MMP2-AS1-202ENST00000569037 553 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AC005412.1-201ENST00000580812 1049 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 LINC01255-206ENST00000591431 441 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AC091057.2-201ENST00000602594 792 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AL136084.2-203ENST00000630758 690 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 PDC-201ENST00000391997 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
RBBP4Q09028 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.6 ms