Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 BMPR1APS1-201ENST00000403332 1598 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AC092920.1-201ENST00000428516 678 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AL451070.1-201ENST00000430143 439 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AL450996.1-201ENST00000445574 1202 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 PPIAP20-201ENST00000449839 135 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AC091685.2-201ENST00000454924 864 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 TAF8-207ENST00000482432 556 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 RPS4XP14-201ENST00000493072 781 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AK3P4-201ENST00000504283 583 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AL390816.1-201ENST00000553990 322 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 PWRN4-201ENST00000563016 420 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AC012588.1-201ENST00000583852 358 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 HNF1A-AS1-205ENST00000619441 343 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 C1orf195-202ENST00000625027 441 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 MGAT4A-203ENST00000409391 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AC110079.2-201ENST00000629462 1512 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AGBL4-201ENST00000334103 881 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 RN7SKP44-201ENST00000363602 316 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 SNORA17A-201ENST00000391185 133 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 OR2AT2P-201ENST00000413438 905 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 ERI3-IT1-201ENST00000414156 619 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AC018832.1-201ENST00000428171 566 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AC111000.4-201ENST00000504301 569 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AC008592.2-201ENST00000506070 571 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 CYCSP22-201ENST00000517555 339 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 IGKV3D-34-201ENST00000522638 302 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AP002373.2-201ENST00000541631 1060 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.3 ms