Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

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Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CENPFP49454 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CENPFP49454 AL031985.3-201ENST00000565390 2449 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CENPFP49454 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CENPFP49454 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CENPFP49454 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CENPFP49454 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CENPFP49454 AC018616.1-201ENST00000524085 546 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CENPFP49454 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CENPFP49454 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CENPFP49454 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CENPFP49454 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CENPFP49454 SYCP3-202ENST00000392924 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
CENPFP49454 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CENPFP49454 NANOGP5-201ENST00000424456 877 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CENPFP49454 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CENPFP49454 AC016687.1-201ENST00000482574 353 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CENPFP49454 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
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CENPFP49454 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CENPFP49454 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CENPFP49454 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CENPFP49454 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CENPFP49454 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CENPFP49454 TTC39DP-201ENST00000416781 1688 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CENPFP49454 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CENPFP49454 DST-201ENST00000244364 16742 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
CENPFP49454 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CENPFP49454 AP000936.3-201ENST00000438127 255 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CENPFP49454 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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CENPFP49454 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
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CENPFP49454 C1orf185-201ENST00000371759 915 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
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CENPFP49454 CLECL1-201ENST00000327839 670 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
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CENPFP49454 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CENPFP49454 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
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CENPFP49454 BTAF1-204ENST00000544642 6938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CENPFP49454 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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CENPFP49454 AC006960.1-201ENST00000419980 153 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CENPFP49454 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
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CENPFP49454 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CENPFP49454 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CENPFP49454 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CENPFP49454 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CENPFP49454 AL354710.1-201ENST00000453641 246 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CENPFP49454 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CENPFP49454 AL445363.2-202ENST00000555361 435 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
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CENPFP49454 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CENPFP49454 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CENPFP49454 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CENPFP49454 AC092045.1-201ENST00000495716 1231 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CENPFP49454 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CENPFP49454 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CENPFP49454 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
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