Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 AC084373.1-201ENST00000603311 235 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 DEFB106B-201ENST00000335479 316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 AC105402.1-201ENST00000413336 545 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 AC024084.1-201ENST00000440744 455 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 AL158069.1-201ENST00000454131 455 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 LARP7P4-201ENST00000481075 878 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 AC097512.1-203ENST00000506425 957 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 FABP5P12-201ENST00000515543 389 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 AC011611.4-201ENST00000547721 779 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 AC022166.1-201ENST00000567851 581 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 AC096947.1-201ENST00000603233 470 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 AC123912.3-201ENST00000600907 1367 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRBP23467 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 CCNB2P1-201ENST00000399411 1150 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 RNU6-564P-201ENST00000410983 104 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 AC010745.4-201ENST00000420130 740 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 MGAT4D-203ENST00000511113 1125 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
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PTPRBP23467 OR6C65-201ENST00000379665 1076 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
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PTPRBP23467 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
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PTPRBP23467 C8orf89-201ENST00000613105 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
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PTPRBP23467 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 AC009965.2-201ENST00000425328 970 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 AL122008.1-201ENST00000456078 452 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRBP23467 AC023050.1-201ENST00000498198 304 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
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