Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 POC1B-201ENST00000313546 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 FAM81B-201ENST00000283357 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 LRRC37A3-204ENST00000400877 3273 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 MMAA-205ENST00000541599 1437 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 AC087258.1-203ENST00000545400 1629 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 OR5F1-201ENST00000278409 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 AL583835.1-201ENST00000399570 407 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 HMGB3P7-201ENST00000400214 611 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 AC012512.1-201ENST00000446594 718 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 TCEA1P1-201ENST00000449716 880 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 AL122008.1-201ENST00000456078 452 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 AL365356.5-201ENST00000478294 697 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 AC093267.1-201ENST00000489176 961 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 AC011005.3-201ENST00000491624 395 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 NARSP2-201ENST00000518524 679 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 AC005899.7-201ENST00000618199 588 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 TRPC4-207ENST00000426868 2709 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 LINC02365-202ENST00000520280 607 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRAP18433 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
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