Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AC004069.2-201ENST00000505438 1114 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AC087672.2-201ENST00000522498 429 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AL356804.1-201ENST00000553791 448 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AC091588.1-201ENST00000578504 359 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 ZNF415P1-201ENST00000582279 1166 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AC009948.4-201ENST00000604692 675 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AC112220.2-201ENST00000605513 533 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 PRKCQ-AS1-207ENST00000607996 531 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 MESTIT1_2.1-201ENST00000616328 235 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AC018816.2-201ENST00000621460 353 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 KBTBD2-208ENST00000621876 1196 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 CGA-204ENST00000627148 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 PSG6-202ENST00000292125 1391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 BTF3P8-201ENST00000414577 526 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 Z97055.1-201ENST00000419730 712 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AL031313.1-201ENST00000448435 256 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 SYPL1P1-201ENST00000473622 768 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AC004884.2-201ENST00000476569 546 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AC010406.1-201ENST00000507948 555 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 ADGRL3-AS1-204ENST00000509461 481 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AC117834.1-202ENST00000521203 561 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AC092747.2-201ENST00000545069 983 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AC004217.3-201ENST00000551552 878 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 MIR4509-3-201ENST00000578671 94 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AC087399.1-201ENST00000579769 573 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AC005412.1-201ENST00000580812 1049 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 MIR4509-2-201ENST00000583920 94 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AC092354.2-201ENST00000607786 514 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AL591424.2-201ENST00000617023 128 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 MIR4509-1-201ENST00000618224 94 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AC123767.1-202ENST00000620407 817 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AL078595.3-201ENST00000623815 1166 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 LINC01625-201ENST00000454788 1690 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AP002001.2-201ENST00000529025 1469 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 TTC41P-203ENST00000548527 1475 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 ANKRD36P1-201ENST00000344424 659 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 TMEM225-201ENST00000375026 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
LRRTM2O43300 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
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