Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EHD3Q9NZN3 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms