Protein–RNA interactions for Protein: Q9D304

Rnf128, E3 ubiquitin-protein ligase RNF128, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf128Q9D304 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rnf128Q9D304 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rnf128Q9D304 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rnf128Q9D304 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rnf128Q9D304 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rnf128Q9D304 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf128Q9D304 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf128Q9D304 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf128Q9D304 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf128Q9D304 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf128Q9D304 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rnf128Q9D304 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf128Q9D304 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf128Q9D304 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf128Q9D304 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf128Q9D304 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf128Q9D304 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf128Q9D304 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf128Q9D304 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf128Q9D304 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rnf128Q9D304 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf128Q9D304 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf128Q9D304 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf128Q9D304 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf128Q9D304 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf128Q9D304 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf128Q9D304 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf128Q9D304 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnf128Q9D304 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf128Q9D304 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf128Q9D304 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf128Q9D304 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf128Q9D304 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rnf128Q9D304 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf128Q9D304 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf128Q9D304 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf128Q9D304 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf128Q9D304 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf128Q9D304 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf128Q9D304 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf128Q9D304 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf128Q9D304 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf128Q9D304 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf128Q9D304 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf128Q9D304 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf128Q9D304 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf128Q9D304 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf128Q9D304 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf128Q9D304 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rnf128Q9D304 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf128Q9D304 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf128Q9D304 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf128Q9D304 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf128Q9D304 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf128Q9D304 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rnf128Q9D304 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf128Q9D304 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf128Q9D304 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf128Q9D304 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf128Q9D304 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf128Q9D304 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf128Q9D304 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rnf128Q9D304 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf128Q9D304 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf128Q9D304 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf128Q9D304 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf128Q9D304 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf128Q9D304 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf128Q9D304 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf128Q9D304 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rnf128Q9D304 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rnf128Q9D304 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rnf128Q9D304 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rnf128Q9D304 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf128Q9D304 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rnf128Q9D304 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf128Q9D304 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rnf128Q9D304 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf128Q9D304 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rnf128Q9D304 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf128Q9D304 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf128Q9D304 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf128Q9D304 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf128Q9D304 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf128Q9D304 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf128Q9D304 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf128Q9D304 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf128Q9D304 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf128Q9D304 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf128Q9D304 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf128Q9D304 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf128Q9D304 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf128Q9D304 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf128Q9D304 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf128Q9D304 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf128Q9D304 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf128Q9D304 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rnf128Q9D304 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf128Q9D304 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf128Q9D304 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms