Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H5

Trim42, Tripartite motif-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim42Q9D2H5 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms