Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQR7

Psenen, Gamma-secretase subunit PEN-2, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PsenenQ9CQR7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
PsenenQ9CQR7 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PsenenQ9CQR7 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PsenenQ9CQR7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PsenenQ9CQR7 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PsenenQ9CQR7 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PsenenQ9CQR7 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PsenenQ9CQR7 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PsenenQ9CQR7 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PsenenQ9CQR7 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PsenenQ9CQR7 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PsenenQ9CQR7 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PsenenQ9CQR7 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
PsenenQ9CQR7 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PsenenQ9CQR7 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PsenenQ9CQR7 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PsenenQ9CQR7 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PsenenQ9CQR7 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PsenenQ9CQR7 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PsenenQ9CQR7 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PsenenQ9CQR7 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PsenenQ9CQR7 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PsenenQ9CQR7 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PsenenQ9CQR7 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PsenenQ9CQR7 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PsenenQ9CQR7 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PsenenQ9CQR7 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PsenenQ9CQR7 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
PsenenQ9CQR7 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PsenenQ9CQR7 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PsenenQ9CQR7 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PsenenQ9CQR7 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PsenenQ9CQR7 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PsenenQ9CQR7 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
PsenenQ9CQR7 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PsenenQ9CQR7 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PsenenQ9CQR7 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PsenenQ9CQR7 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PsenenQ9CQR7 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PsenenQ9CQR7 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PsenenQ9CQR7 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PsenenQ9CQR7 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PsenenQ9CQR7 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PsenenQ9CQR7 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PsenenQ9CQR7 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PsenenQ9CQR7 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PsenenQ9CQR7 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PsenenQ9CQR7 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PsenenQ9CQR7 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PsenenQ9CQR7 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PsenenQ9CQR7 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PsenenQ9CQR7 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PsenenQ9CQR7 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PsenenQ9CQR7 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PsenenQ9CQR7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PsenenQ9CQR7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PsenenQ9CQR7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PsenenQ9CQR7 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PsenenQ9CQR7 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PsenenQ9CQR7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PsenenQ9CQR7 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PsenenQ9CQR7 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PsenenQ9CQR7 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PsenenQ9CQR7 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PsenenQ9CQR7 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PsenenQ9CQR7 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PsenenQ9CQR7 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PsenenQ9CQR7 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PsenenQ9CQR7 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PsenenQ9CQR7 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PsenenQ9CQR7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PsenenQ9CQR7 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PsenenQ9CQR7 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PsenenQ9CQR7 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PsenenQ9CQR7 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PsenenQ9CQR7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PsenenQ9CQR7 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
PsenenQ9CQR7 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
PsenenQ9CQR7 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PsenenQ9CQR7 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PsenenQ9CQR7 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PsenenQ9CQR7 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PsenenQ9CQR7 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PsenenQ9CQR7 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PsenenQ9CQR7 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PsenenQ9CQR7 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PsenenQ9CQR7 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PsenenQ9CQR7 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PsenenQ9CQR7 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PsenenQ9CQR7 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PsenenQ9CQR7 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PsenenQ9CQR7 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PsenenQ9CQR7 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
PsenenQ9CQR7 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PsenenQ9CQR7 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PsenenQ9CQR7 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PsenenQ9CQR7 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PsenenQ9CQR7 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PsenenQ9CQR7 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PsenenQ9CQR7 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms