Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ8

Dctn2, Dynactin subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn2Q99KJ8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dctn2Q99KJ8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dctn2Q99KJ8 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dctn2Q99KJ8 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dctn2Q99KJ8 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dctn2Q99KJ8 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dctn2Q99KJ8 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dctn2Q99KJ8 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dctn2Q99KJ8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dctn2Q99KJ8 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dctn2Q99KJ8 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dctn2Q99KJ8 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dctn2Q99KJ8 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dctn2Q99KJ8 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dctn2Q99KJ8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dctn2Q99KJ8 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dctn2Q99KJ8 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dctn2Q99KJ8 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dctn2Q99KJ8 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dctn2Q99KJ8 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dctn2Q99KJ8 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dctn2Q99KJ8 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dctn2Q99KJ8 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dctn2Q99KJ8 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dctn2Q99KJ8 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dctn2Q99KJ8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dctn2Q99KJ8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dctn2Q99KJ8 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dctn2Q99KJ8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dctn2Q99KJ8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dctn2Q99KJ8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dctn2Q99KJ8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dctn2Q99KJ8 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dctn2Q99KJ8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dctn2Q99KJ8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dctn2Q99KJ8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dctn2Q99KJ8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dctn2Q99KJ8 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dctn2Q99KJ8 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dctn2Q99KJ8 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dctn2Q99KJ8 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dctn2Q99KJ8 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dctn2Q99KJ8 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dctn2Q99KJ8 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dctn2Q99KJ8 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dctn2Q99KJ8 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dctn2Q99KJ8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dctn2Q99KJ8 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dctn2Q99KJ8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dctn2Q99KJ8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dctn2Q99KJ8 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dctn2Q99KJ8 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dctn2Q99KJ8 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dctn2Q99KJ8 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dctn2Q99KJ8 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dctn2Q99KJ8 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dctn2Q99KJ8 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dctn2Q99KJ8 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dctn2Q99KJ8 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dctn2Q99KJ8 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dctn2Q99KJ8 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dctn2Q99KJ8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dctn2Q99KJ8 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dctn2Q99KJ8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dctn2Q99KJ8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Dctn2Q99KJ8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dctn2Q99KJ8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dctn2Q99KJ8 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dctn2Q99KJ8 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dctn2Q99KJ8 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dctn2Q99KJ8 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dctn2Q99KJ8 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dctn2Q99KJ8 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dctn2Q99KJ8 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dctn2Q99KJ8 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dctn2Q99KJ8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dctn2Q99KJ8 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dctn2Q99KJ8 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dctn2Q99KJ8 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dctn2Q99KJ8 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dctn2Q99KJ8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dctn2Q99KJ8 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dctn2Q99KJ8 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dctn2Q99KJ8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dctn2Q99KJ8 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dctn2Q99KJ8 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dctn2Q99KJ8 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dctn2Q99KJ8 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dctn2Q99KJ8 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dctn2Q99KJ8 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dctn2Q99KJ8 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dctn2Q99KJ8 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dctn2Q99KJ8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dctn2Q99KJ8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dctn2Q99KJ8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dctn2Q99KJ8 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dctn2Q99KJ8 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dctn2Q99KJ8 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Dctn2Q99KJ8 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dctn2Q99KJ8 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms