Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT1

Gatb, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GatbQ99JT1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GatbQ99JT1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GatbQ99JT1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GatbQ99JT1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GatbQ99JT1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GatbQ99JT1 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GatbQ99JT1 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GatbQ99JT1 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GatbQ99JT1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GatbQ99JT1 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GatbQ99JT1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GatbQ99JT1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GatbQ99JT1 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GatbQ99JT1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GatbQ99JT1 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GatbQ99JT1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GatbQ99JT1 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GatbQ99JT1 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GatbQ99JT1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GatbQ99JT1 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GatbQ99JT1 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GatbQ99JT1 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GatbQ99JT1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GatbQ99JT1 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GatbQ99JT1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GatbQ99JT1 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GatbQ99JT1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GatbQ99JT1 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GatbQ99JT1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GatbQ99JT1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GatbQ99JT1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GatbQ99JT1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GatbQ99JT1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GatbQ99JT1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GatbQ99JT1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GatbQ99JT1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GatbQ99JT1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GatbQ99JT1 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GatbQ99JT1 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GatbQ99JT1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GatbQ99JT1 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GatbQ99JT1 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GatbQ99JT1 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GatbQ99JT1 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GatbQ99JT1 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GatbQ99JT1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GatbQ99JT1 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GatbQ99JT1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
GatbQ99JT1 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GatbQ99JT1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GatbQ99JT1 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
GatbQ99JT1 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GatbQ99JT1 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GatbQ99JT1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GatbQ99JT1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GatbQ99JT1 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GatbQ99JT1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
GatbQ99JT1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
GatbQ99JT1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GatbQ99JT1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GatbQ99JT1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GatbQ99JT1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GatbQ99JT1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GatbQ99JT1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GatbQ99JT1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GatbQ99JT1 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GatbQ99JT1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
GatbQ99JT1 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GatbQ99JT1 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GatbQ99JT1 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GatbQ99JT1 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GatbQ99JT1 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GatbQ99JT1 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GatbQ99JT1 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GatbQ99JT1 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
GatbQ99JT1 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GatbQ99JT1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GatbQ99JT1 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GatbQ99JT1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GatbQ99JT1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GatbQ99JT1 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GatbQ99JT1 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GatbQ99JT1 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GatbQ99JT1 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GatbQ99JT1 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GatbQ99JT1 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GatbQ99JT1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GatbQ99JT1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GatbQ99JT1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GatbQ99JT1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GatbQ99JT1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GatbQ99JT1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GatbQ99JT1 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GatbQ99JT1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GatbQ99JT1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GatbQ99JT1 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GatbQ99JT1 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GatbQ99JT1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GatbQ99JT1 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GatbQ99JT1 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms