Protein–RNA interactions for Protein: Q99JG7

Tnip2, TNFAIP3-interacting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip2Q99JG7 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnip2Q99JG7 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnip2Q99JG7 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnip2Q99JG7 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnip2Q99JG7 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnip2Q99JG7 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnip2Q99JG7 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnip2Q99JG7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnip2Q99JG7 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnip2Q99JG7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnip2Q99JG7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnip2Q99JG7 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnip2Q99JG7 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnip2Q99JG7 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnip2Q99JG7 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnip2Q99JG7 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnip2Q99JG7 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnip2Q99JG7 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnip2Q99JG7 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnip2Q99JG7 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnip2Q99JG7 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnip2Q99JG7 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnip2Q99JG7 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnip2Q99JG7 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnip2Q99JG7 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnip2Q99JG7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnip2Q99JG7 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnip2Q99JG7 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnip2Q99JG7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnip2Q99JG7 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnip2Q99JG7 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnip2Q99JG7 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnip2Q99JG7 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnip2Q99JG7 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnip2Q99JG7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnip2Q99JG7 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnip2Q99JG7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnip2Q99JG7 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnip2Q99JG7 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnip2Q99JG7 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnip2Q99JG7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnip2Q99JG7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnip2Q99JG7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnip2Q99JG7 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnip2Q99JG7 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnip2Q99JG7 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnip2Q99JG7 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnip2Q99JG7 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnip2Q99JG7 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnip2Q99JG7 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnip2Q99JG7 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnip2Q99JG7 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnip2Q99JG7 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnip2Q99JG7 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnip2Q99JG7 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnip2Q99JG7 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnip2Q99JG7 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnip2Q99JG7 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnip2Q99JG7 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnip2Q99JG7 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnip2Q99JG7 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnip2Q99JG7 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnip2Q99JG7 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnip2Q99JG7 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnip2Q99JG7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnip2Q99JG7 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnip2Q99JG7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnip2Q99JG7 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnip2Q99JG7 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnip2Q99JG7 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnip2Q99JG7 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnip2Q99JG7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnip2Q99JG7 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnip2Q99JG7 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnip2Q99JG7 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnip2Q99JG7 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnip2Q99JG7 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnip2Q99JG7 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnip2Q99JG7 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnip2Q99JG7 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnip2Q99JG7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnip2Q99JG7 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnip2Q99JG7 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnip2Q99JG7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnip2Q99JG7 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnip2Q99JG7 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnip2Q99JG7 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnip2Q99JG7 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnip2Q99JG7 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnip2Q99JG7 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnip2Q99JG7 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnip2Q99JG7 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnip2Q99JG7 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnip2Q99JG7 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnip2Q99JG7 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnip2Q99JG7 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnip2Q99JG7 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnip2Q99JG7 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnip2Q99JG7 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnip2Q99JG7 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms