Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN9

GJD4, Gap junction delta-4 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD4Q96KN9 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GJD4Q96KN9 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms