Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg16l1Q8C0J2 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms