Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGH4

Reep1, Receptor expression-enhancing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep1Q8BGH4 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Reep1Q8BGH4 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Reep1Q8BGH4 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Reep1Q8BGH4 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Reep1Q8BGH4 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Reep1Q8BGH4 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Reep1Q8BGH4 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Reep1Q8BGH4 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Reep1Q8BGH4 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Reep1Q8BGH4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Reep1Q8BGH4 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Reep1Q8BGH4 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Reep1Q8BGH4 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Reep1Q8BGH4 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Reep1Q8BGH4 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Reep1Q8BGH4 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Reep1Q8BGH4 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Reep1Q8BGH4 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Reep1Q8BGH4 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Reep1Q8BGH4 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Reep1Q8BGH4 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Reep1Q8BGH4 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Reep1Q8BGH4 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Reep1Q8BGH4 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Reep1Q8BGH4 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Reep1Q8BGH4 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Reep1Q8BGH4 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Reep1Q8BGH4 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep1Q8BGH4 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep1Q8BGH4 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep1Q8BGH4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep1Q8BGH4 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep1Q8BGH4 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep1Q8BGH4 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep1Q8BGH4 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep1Q8BGH4 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep1Q8BGH4 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep1Q8BGH4 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep1Q8BGH4 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep1Q8BGH4 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep1Q8BGH4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep1Q8BGH4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep1Q8BGH4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep1Q8BGH4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep1Q8BGH4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep1Q8BGH4 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep1Q8BGH4 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep1Q8BGH4 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep1Q8BGH4 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep1Q8BGH4 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep1Q8BGH4 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep1Q8BGH4 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Reep1Q8BGH4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Reep1Q8BGH4 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Reep1Q8BGH4 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Reep1Q8BGH4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Reep1Q8BGH4 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Reep1Q8BGH4 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Reep1Q8BGH4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Reep1Q8BGH4 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Reep1Q8BGH4 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Reep1Q8BGH4 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Reep1Q8BGH4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Reep1Q8BGH4 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Reep1Q8BGH4 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Reep1Q8BGH4 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Reep1Q8BGH4 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Reep1Q8BGH4 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Reep1Q8BGH4 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Reep1Q8BGH4 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Reep1Q8BGH4 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Reep1Q8BGH4 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Reep1Q8BGH4 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep1Q8BGH4 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep1Q8BGH4 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep1Q8BGH4 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep1Q8BGH4 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep1Q8BGH4 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep1Q8BGH4 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep1Q8BGH4 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep1Q8BGH4 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep1Q8BGH4 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep1Q8BGH4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep1Q8BGH4 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep1Q8BGH4 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep1Q8BGH4 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep1Q8BGH4 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep1Q8BGH4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep1Q8BGH4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep1Q8BGH4 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep1Q8BGH4 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep1Q8BGH4 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep1Q8BGH4 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep1Q8BGH4 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep1Q8BGH4 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep1Q8BGH4 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep1Q8BGH4 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep1Q8BGH4 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep1Q8BGH4 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Reep1Q8BGH4 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms