Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC171Q6TFL3 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms