Protein–RNA interactions for Protein: Q6RHW0

Krt9, Keratin, type I cytoskeletal 9, mousemouse

Predictions only

Length 743 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt9Q6RHW0 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt9Q6RHW0 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt9Q6RHW0 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt9Q6RHW0 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt9Q6RHW0 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt9Q6RHW0 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt9Q6RHW0 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt9Q6RHW0 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt9Q6RHW0 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt9Q6RHW0 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt9Q6RHW0 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt9Q6RHW0 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt9Q6RHW0 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt9Q6RHW0 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt9Q6RHW0 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt9Q6RHW0 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt9Q6RHW0 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt9Q6RHW0 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt9Q6RHW0 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt9Q6RHW0 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt9Q6RHW0 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt9Q6RHW0 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt9Q6RHW0 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt9Q6RHW0 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt9Q6RHW0 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt9Q6RHW0 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt9Q6RHW0 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt9Q6RHW0 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt9Q6RHW0 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt9Q6RHW0 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt9Q6RHW0 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt9Q6RHW0 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt9Q6RHW0 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt9Q6RHW0 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt9Q6RHW0 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt9Q6RHW0 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt9Q6RHW0 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt9Q6RHW0 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt9Q6RHW0 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt9Q6RHW0 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt9Q6RHW0 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt9Q6RHW0 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt9Q6RHW0 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt9Q6RHW0 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt9Q6RHW0 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt9Q6RHW0 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt9Q6RHW0 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt9Q6RHW0 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt9Q6RHW0 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt9Q6RHW0 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt9Q6RHW0 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt9Q6RHW0 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt9Q6RHW0 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt9Q6RHW0 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt9Q6RHW0 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt9Q6RHW0 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt9Q6RHW0 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt9Q6RHW0 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt9Q6RHW0 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt9Q6RHW0 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt9Q6RHW0 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt9Q6RHW0 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Krt9Q6RHW0 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Krt9Q6RHW0 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Krt9Q6RHW0 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Krt9Q6RHW0 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Krt9Q6RHW0 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt9Q6RHW0 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt9Q6RHW0 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt9Q6RHW0 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt9Q6RHW0 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt9Q6RHW0 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt9Q6RHW0 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt9Q6RHW0 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt9Q6RHW0 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt9Q6RHW0 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt9Q6RHW0 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt9Q6RHW0 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt9Q6RHW0 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt9Q6RHW0 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt9Q6RHW0 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt9Q6RHW0 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt9Q6RHW0 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt9Q6RHW0 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt9Q6RHW0 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt9Q6RHW0 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt9Q6RHW0 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt9Q6RHW0 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt9Q6RHW0 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt9Q6RHW0 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt9Q6RHW0 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt9Q6RHW0 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt9Q6RHW0 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt9Q6RHW0 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt9Q6RHW0 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt9Q6RHW0 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt9Q6RHW0 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt9Q6RHW0 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt9Q6RHW0 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt9Q6RHW0 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms