Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
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LAMA3Q16787 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
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LAMA3Q16787 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
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LAMA3Q16787 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
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LAMA3Q16787 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
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LAMA3Q16787 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LAMA3Q16787 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
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LAMA3Q16787 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
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LAMA3Q16787 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LAMA3Q16787 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
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