Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFIXQ14938 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFIXQ14938 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFIXQ14938 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NFIXQ14938 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NFIXQ14938 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NFIXQ14938 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NFIXQ14938 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NFIXQ14938 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NFIXQ14938 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NFIXQ14938 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NFIXQ14938 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NFIXQ14938 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NFIXQ14938 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NFIXQ14938 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NFIXQ14938 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NFIXQ14938 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NFIXQ14938 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NFIXQ14938 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NFIXQ14938 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NFIXQ14938 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFIXQ14938 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFIXQ14938 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFIXQ14938 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFIXQ14938 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFIXQ14938 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFIXQ14938 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFIXQ14938 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFIXQ14938 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFIXQ14938 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NFIXQ14938 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFIXQ14938 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFIXQ14938 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NFIXQ14938 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFIXQ14938 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFIXQ14938 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NFIXQ14938 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFIXQ14938 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFIXQ14938 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFIXQ14938 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFIXQ14938 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
NFIXQ14938 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NFIXQ14938 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
NFIXQ14938 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NFIXQ14938 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NFIXQ14938 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
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