Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
COL4A6Q14031 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
COL4A6Q14031 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
COL4A6Q14031 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
COL4A6Q14031 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
COL4A6Q14031 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
COL4A6Q14031 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
COL4A6Q14031 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
COL4A6Q14031 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COL4A6Q14031 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COL4A6Q14031 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COL4A6Q14031 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COL4A6Q14031 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COL4A6Q14031 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COL4A6Q14031 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COL4A6Q14031 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COL4A6Q14031 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COL4A6Q14031 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COL4A6Q14031 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COL4A6Q14031 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COL4A6Q14031 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
COL4A6Q14031 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COL4A6Q14031 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COL4A6Q14031 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COL4A6Q14031 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COL4A6Q14031 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
COL4A6Q14031 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COL4A6Q14031 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COL4A6Q14031 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
COL4A6Q14031 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COL4A6Q14031 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COL4A6Q14031 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COL4A6Q14031 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COL4A6Q14031 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
COL4A6Q14031 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COL4A6Q14031 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COL4A6Q14031 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COL4A6Q14031 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COL4A6Q14031 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COL4A6Q14031 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COL4A6Q14031 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COL4A6Q14031 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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COL4A6Q14031 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COL4A6Q14031 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COL4A6Q14031 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
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COL4A6Q14031 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COL4A6Q14031 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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COL4A6Q14031 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
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COL4A6Q14031 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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COL4A6Q14031 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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COL4A6Q14031 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COL4A6Q14031 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COL4A6Q14031 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COL4A6Q14031 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
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COL4A6Q14031 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COL4A6Q14031 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COL4A6Q14031 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
COL4A6Q14031 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COL4A6Q14031 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
COL4A6Q14031 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COL4A6Q14031 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COL4A6Q14031 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COL4A6Q14031 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COL4A6Q14031 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COL4A6Q14031 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COL4A6Q14031 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COL4A6Q14031 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COL4A6Q14031 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COL4A6Q14031 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COL4A6Q14031 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COL4A6Q14031 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
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