Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx1P81068 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx1P81068 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx1P81068 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx1P81068 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx1P81068 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx1P81068 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx1P81068 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx1P81068 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx1P81068 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx1P81068 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx1P81068 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx1P81068 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx1P81068 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx1P81068 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx1P81068 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx1P81068 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx1P81068 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx1P81068 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx1P81068 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx1P81068 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx1P81068 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx1P81068 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx1P81068 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx1P81068 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx1P81068 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx1P81068 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx1P81068 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx1P81068 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx1P81068 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx1P81068 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx1P81068 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx1P81068 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx1P81068 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx1P81068 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx1P81068 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx1P81068 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx1P81068 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx1P81068 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx1P81068 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx1P81068 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx1P81068 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx1P81068 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx1P81068 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx1P81068 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx1P81068 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx1P81068 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx1P81068 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx1P81068 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx1P81068 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx1P81068 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx1P81068 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx1P81068 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx1P81068 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx1P81068 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx1P81068 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx1P81068 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx1P81068 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx1P81068 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx1P81068 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx1P81068 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx1P81068 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx1P81068 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irx1P81068 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irx1P81068 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irx1P81068 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irx1P81068 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irx1P81068 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irx1P81068 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irx1P81068 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irx1P81068 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irx1P81068 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irx1P81068 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Irx1P81068 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irx1P81068 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irx1P81068 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irx1P81068 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irx1P81068 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irx1P81068 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irx1P81068 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irx1P81068 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irx1P81068 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms