Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIK1P57059 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIK1P57059 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIK1P57059 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIK1P57059 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIK1P57059 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIK1P57059 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIK1P57059 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIK1P57059 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIK1P57059 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIK1P57059 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SIK1P57059 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIK1P57059 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIK1P57059 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIK1P57059 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIK1P57059 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIK1P57059 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIK1P57059 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIK1P57059 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIK1P57059 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIK1P57059 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIK1P57059 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIK1P57059 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIK1P57059 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SIK1P57059 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIK1P57059 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIK1P57059 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SIK1P57059 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIK1P57059 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SIK1P57059 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIK1P57059 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SIK1P57059 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIK1P57059 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIK1P57059 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIK1P57059 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SIK1P57059 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIK1P57059 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIK1P57059 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIK1P57059 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIK1P57059 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIK1P57059 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIK1P57059 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIK1P57059 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SIK1P57059 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIK1P57059 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIK1P57059 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIK1P57059 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIK1P57059 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIK1P57059 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIK1P57059 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIK1P57059 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIK1P57059 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIK1P57059 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIK1P57059 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIK1P57059 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIK1P57059 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIK1P57059 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIK1P57059 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIK1P57059 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIK1P57059 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIK1P57059 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIK1P57059 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SIK1P57059 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIK1P57059 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIK1P57059 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIK1P57059 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIK1P57059 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIK1P57059 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIK1P57059 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIK1P57059 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIK1P57059 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SIK1P57059 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIK1P57059 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIK1P57059 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIK1P57059 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIK1P57059 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIK1P57059 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SIK1P57059 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIK1P57059 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIK1P57059 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIK1P57059 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIK1P57059 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIK1P57059 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIK1P57059 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIK1P57059 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIK1P57059 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SIK1P57059 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIK1P57059 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SIK1P57059 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIK1P57059 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIK1P57059 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIK1P57059 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIK1P57059 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIK1P57059 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIK1P57059 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIK1P57059 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIK1P57059 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIK1P57059 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIK1P57059 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIK1P57059 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms