Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRHP20396 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRHP20396 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRHP20396 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TRHP20396 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TRHP20396 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TRHP20396 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TRHP20396 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TRHP20396 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
TRHP20396 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
TRHP20396 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TRHP20396 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TRHP20396 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TRHP20396 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TRHP20396 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TRHP20396 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TRHP20396 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TRHP20396 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TRHP20396 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TRHP20396 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TRHP20396 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TRHP20396 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
TRHP20396 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
TRHP20396 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TRHP20396 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TRHP20396 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TRHP20396 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TRHP20396 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TRHP20396 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TRHP20396 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TRHP20396 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TRHP20396 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TRHP20396 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
TRHP20396 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TRHP20396 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TRHP20396 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TRHP20396 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TRHP20396 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
TRHP20396 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
TRHP20396 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TRHP20396 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TRHP20396 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TRHP20396 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TRHP20396 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TRHP20396 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
TRHP20396 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TRHP20396 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TRHP20396 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
TRHP20396 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TRHP20396 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TRHP20396 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TRHP20396 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TRHP20396 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
TRHP20396 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
TRHP20396 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
TRHP20396 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
TRHP20396 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TRHP20396 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TRHP20396 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TRHP20396 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TRHP20396 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TRHP20396 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TRHP20396 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TRHP20396 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TRHP20396 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TRHP20396 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
TRHP20396 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TRHP20396 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TRHP20396 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TRHP20396 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
TRHP20396 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
TRHP20396 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
TRHP20396 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TRHP20396 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TRHP20396 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TRHP20396 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TRHP20396 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TRHP20396 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TRHP20396 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TRHP20396 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TRHP20396 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TRHP20396 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TRHP20396 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TRHP20396 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TRHP20396 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TRHP20396 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
TRHP20396 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TRHP20396 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TRHP20396 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TRHP20396 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TRHP20396 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TRHP20396 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TRHP20396 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TRHP20396 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
TRHP20396 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TRHP20396 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TRHP20396 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
TRHP20396 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TRHP20396 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TRHP20396 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms