Protein–RNA interactions for Protein: O88398

Avil, Advillin, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AvilO88398 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AvilO88398 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AvilO88398 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
AvilO88398 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AvilO88398 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AvilO88398 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AvilO88398 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AvilO88398 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
AvilO88398 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AvilO88398 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AvilO88398 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AvilO88398 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AvilO88398 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AvilO88398 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AvilO88398 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AvilO88398 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AvilO88398 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AvilO88398 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AvilO88398 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AvilO88398 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AvilO88398 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AvilO88398 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AvilO88398 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AvilO88398 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AvilO88398 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AvilO88398 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AvilO88398 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AvilO88398 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AvilO88398 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AvilO88398 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
AvilO88398 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AvilO88398 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AvilO88398 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AvilO88398 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AvilO88398 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AvilO88398 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AvilO88398 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AvilO88398 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AvilO88398 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AvilO88398 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
AvilO88398 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AvilO88398 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AvilO88398 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
AvilO88398 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AvilO88398 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AvilO88398 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AvilO88398 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AvilO88398 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AvilO88398 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AvilO88398 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AvilO88398 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AvilO88398 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AvilO88398 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AvilO88398 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AvilO88398 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AvilO88398 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AvilO88398 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AvilO88398 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AvilO88398 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AvilO88398 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AvilO88398 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AvilO88398 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AvilO88398 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AvilO88398 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
AvilO88398 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
AvilO88398 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AvilO88398 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AvilO88398 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AvilO88398 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AvilO88398 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AvilO88398 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AvilO88398 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AvilO88398 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AvilO88398 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AvilO88398 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AvilO88398 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AvilO88398 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AvilO88398 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AvilO88398 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AvilO88398 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AvilO88398 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AvilO88398 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AvilO88398 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AvilO88398 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AvilO88398 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AvilO88398 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AvilO88398 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AvilO88398 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AvilO88398 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AvilO88398 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AvilO88398 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AvilO88398 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AvilO88398 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AvilO88398 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AvilO88398 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AvilO88398 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AvilO88398 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AvilO88398 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AvilO88398 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AvilO88398 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms