Protein–RNA interactions for Protein: O60911

CTSV, Cathepsin L2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSVO60911 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTSVO60911 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTSVO60911 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTSVO60911 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTSVO60911 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTSVO60911 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTSVO60911 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTSVO60911 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTSVO60911 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTSVO60911 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTSVO60911 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTSVO60911 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTSVO60911 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTSVO60911 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTSVO60911 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTSVO60911 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTSVO60911 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTSVO60911 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTSVO60911 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTSVO60911 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTSVO60911 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CTSVO60911 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTSVO60911 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTSVO60911 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTSVO60911 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTSVO60911 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTSVO60911 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTSVO60911 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTSVO60911 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTSVO60911 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTSVO60911 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTSVO60911 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTSVO60911 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTSVO60911 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTSVO60911 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTSVO60911 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTSVO60911 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTSVO60911 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTSVO60911 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTSVO60911 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTSVO60911 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTSVO60911 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTSVO60911 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTSVO60911 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTSVO60911 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTSVO60911 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTSVO60911 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CTSVO60911 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTSVO60911 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTSVO60911 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTSVO60911 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTSVO60911 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTSVO60911 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTSVO60911 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTSVO60911 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTSVO60911 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTSVO60911 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTSVO60911 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTSVO60911 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTSVO60911 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTSVO60911 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTSVO60911 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTSVO60911 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTSVO60911 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTSVO60911 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTSVO60911 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTSVO60911 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTSVO60911 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTSVO60911 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTSVO60911 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTSVO60911 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTSVO60911 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTSVO60911 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CTSVO60911 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CTSVO60911 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CTSVO60911 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTSVO60911 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTSVO60911 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTSVO60911 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTSVO60911 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTSVO60911 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTSVO60911 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTSVO60911 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTSVO60911 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTSVO60911 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CTSVO60911 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTSVO60911 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTSVO60911 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTSVO60911 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTSVO60911 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTSVO60911 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTSVO60911 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CTSVO60911 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTSVO60911 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTSVO60911 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTSVO60911 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTSVO60911 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTSVO60911 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTSVO60911 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTSVO60911 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms