Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn4O35054 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn4O35054 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms