Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

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Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CEP290O15078 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CEP290O15078 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CEP290O15078 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CEP290O15078 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CEP290O15078 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CEP290O15078 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CEP290O15078 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CEP290O15078 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CEP290O15078 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CEP290O15078 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CEP290O15078 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CEP290O15078 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CEP290O15078 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CEP290O15078 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CEP290O15078 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CEP290O15078 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CEP290O15078 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CEP290O15078 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CEP290O15078 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CEP290O15078 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CEP290O15078 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CEP290O15078 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CEP290O15078 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CEP290O15078 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CEP290O15078 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CEP290O15078 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CEP290O15078 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CEP290O15078 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CEP290O15078 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CEP290O15078 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CEP290O15078 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
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CEP290O15078 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
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CEP290O15078 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
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CEP290O15078 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
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CEP290O15078 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CEP290O15078 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CEP290O15078 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CEP290O15078 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
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CEP290O15078 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CEP290O15078 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CEP290O15078 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CEP290O15078 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CEP290O15078 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CEP290O15078 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CEP290O15078 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CEP290O15078 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CEP290O15078 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CEP290O15078 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CEP290O15078 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CEP290O15078 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CEP290O15078 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
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