Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Cbfa2t3-203ENSMUST00000127984 7645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Fbxl20-201ENSMUST00000103143 8601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Gm20538F6Z9R1 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms