Protein–RNA interactions for Protein: B9EKE5

Catip, Ciliogenesis-associated TTC17-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatipB9EKE5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CatipB9EKE5 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CatipB9EKE5 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CatipB9EKE5 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CatipB9EKE5 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CatipB9EKE5 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CatipB9EKE5 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CatipB9EKE5 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CatipB9EKE5 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms