Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P1

Trbv30, T cell receptor beta, variable 30 (Fragment), mousemouse

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv30A0A0B4J1P1 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trbv30A0A0B4J1P1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Trbv30A0A0B4J1P1 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Trbv30A0A0B4J1P1 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Trbv30A0A0B4J1P1 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trbv30A0A0B4J1P1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trbv30A0A0B4J1P1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trbv30A0A0B4J1P1 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trbv30A0A0B4J1P1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trbv30A0A0B4J1P1 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trbv30A0A0B4J1P1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trbv30A0A0B4J1P1 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trbv30A0A0B4J1P1 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trbv30A0A0B4J1P1 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trbv30A0A0B4J1P1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trbv30A0A0B4J1P1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trbv30A0A0B4J1P1 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trbv30A0A0B4J1P1 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trbv30A0A0B4J1P1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trbv30A0A0B4J1P1 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trbv30A0A0B4J1P1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trbv30A0A0B4J1P1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trbv30A0A0B4J1P1 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trbv30A0A0B4J1P1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trbv30A0A0B4J1P1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trbv30A0A0B4J1P1 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trbv30A0A0B4J1P1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trbv30A0A0B4J1P1 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trbv30A0A0B4J1P1 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trbv30A0A0B4J1P1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trbv30A0A0B4J1P1 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trbv30A0A0B4J1P1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trbv30A0A0B4J1P1 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trbv30A0A0B4J1P1 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trbv30A0A0B4J1P1 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trbv30A0A0B4J1P1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trbv30A0A0B4J1P1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trbv30A0A0B4J1P1 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trbv30A0A0B4J1P1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trbv30A0A0B4J1P1 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trbv30A0A0B4J1P1 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trbv30A0A0B4J1P1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Trbv30A0A0B4J1P1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trbv30A0A0B4J1P1 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trbv30A0A0B4J1P1 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trbv30A0A0B4J1P1 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trbv30A0A0B4J1P1 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trbv30A0A0B4J1P1 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trbv30A0A0B4J1P1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Trbv30A0A0B4J1P1 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trbv30A0A0B4J1P1 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trbv30A0A0B4J1P1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trbv30A0A0B4J1P1 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Trbv30A0A0B4J1P1 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trbv30A0A0B4J1P1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trbv30A0A0B4J1P1 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trbv30A0A0B4J1P1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trbv30A0A0B4J1P1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trbv30A0A0B4J1P1 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trbv30A0A0B4J1P1 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trbv30A0A0B4J1P1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trbv30A0A0B4J1P1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trbv30A0A0B4J1P1 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trbv30A0A0B4J1P1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trbv30A0A0B4J1P1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trbv30A0A0B4J1P1 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trbv30A0A0B4J1P1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trbv30A0A0B4J1P1 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trbv30A0A0B4J1P1 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Trbv30A0A0B4J1P1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trbv30A0A0B4J1P1 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Trbv30A0A0B4J1P1 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trbv30A0A0B4J1P1 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trbv30A0A0B4J1P1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trbv30A0A0B4J1P1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trbv30A0A0B4J1P1 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trbv30A0A0B4J1P1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Trbv30A0A0B4J1P1 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trbv30A0A0B4J1P1 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trbv30A0A0B4J1P1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trbv30A0A0B4J1P1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trbv30A0A0B4J1P1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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