Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 AC008033.1-201ENST00000216407 1162 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 OR2AP1-201ENST00000321688 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 AL158212.2-201ENST00000369391 460 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SKP222-201ENST00000410651 315 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 IFNAR2-206ENST00000413881 710 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 VDAC1P6-201ENST00000430062 855 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 AL035454.1-201ENST00000470758 433 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 AC015724.1-201ENST00000478577 156 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 RPL23AP72-201ENST00000492447 435 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 AC010342.1-201ENST00000514047 877 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 GABARAPL1-212ENST00000543602 653 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 AC005908.2-201ENST00000546078 530 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 AL049839.1-201ENST00000556151 657 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 CFL2-206ENST00000556161 546 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 AC103876.1-201ENST00000568634 418 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 AL590235.2-201ENST00000602641 632 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 AC010424.2-201ENST00000607594 443 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 AL355512.1-201ENST00000609514 488 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 AC055764.2-201ENST00000610089 670 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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SH3BP1Q9Y3L3 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 AP005264.7-201ENST00000625003 745 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 SLC38A11-204ENST00000409662 1542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 CLEC7A-202ENST00000304084 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 OR51F2-201ENST00000322110 993 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP345-201ENST00000410646 108 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 AL807761.1-201ENST00000417622 171 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 AL590385.1-201ENST00000419446 462 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 BMS1P19-201ENST00000433925 393 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 AC004865.1-201ENST00000442276 1003 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SH3BP1Q9Y3L3 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
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