Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
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FOXQ1Q9C009 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
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FOXQ1Q9C009 ZFAND6-223ENST00000616533 1653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
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FOXQ1Q9C009 MSR1-204ENST00000381998 2826 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 AC011155.1-201ENST00000316512 456 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
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FOXQ1Q9C009 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXQ1Q9C009 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
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