Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AC068112.1-201ENST00000580057 346 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AC009303.2-201ENST00000585381 1083 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AC006116.9-201ENST00000591630 649 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AC119501.1-201ENST00000603646 475 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 ITGA9-AS1-218ENST00000630762 751 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 CXCL11-201ENST00000306621 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 ADGRL2-208ENST00000370725 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 RPS4XP5-202ENST00000449995 1334 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 OR10J6P-201ENST00000289731 930 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 GSTA8P-201ENST00000404253 637 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AC006960.1-201ENST00000419980 153 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 LINC02263-202ENST00000420701 597 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 DIAPH3-AS2-201ENST00000428656 367 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 PPIAP17-201ENST00000438507 471 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AC009263.1-201ENST00000441193 1239 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 RPS7P5-201ENST00000441482 581 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AC097262.1-201ENST00000452559 548 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 HMGB1P23-201ENST00000518743 568 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 COX6B1P6-201ENST00000522347 255 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 RAB3IP-214ENST00000550847 670 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AC016526.2-201ENST00000554225 520 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AC138207.6-203ENST00000581652 565 ntTSL 4 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AC025682.1-201ENST00000582389 437 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AC090616.2-202ENST00000584248 222 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AP000811.1-201ENST00000603803 651 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AC244472.2-201ENST00000617639 406 ntAPPRIS P1 BASIC4.32□□□□□ -1.72
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TM6SF1Q9BZW5 AC016717.3-201ENST00000624730 554 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 OR10K1-203ENST00000641432 3775 ntAPPRIS P1 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
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TM6SF1Q9BZW5 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 FABP12P1-201ENST00000401911 322 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AC100848.1-201ENST00000417298 637 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 PLCE1-AS2-201ENST00000419353 459 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AL031123.1-201ENST00000432823 568 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 DIAPH3-AS1-203ENST00000435636 467 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 RPL7P28-201ENST00000437739 740 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 AC239809.1-201ENST00000450470 217 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TM6SF1Q9BZW5 ZBTB8OS-205ENST00000465588 548 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
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