Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AL356276.2-201ENST00000435919 558 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AC096775.1-201ENST00000437724 448 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AL121974.1-201ENST00000437859 377 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 snoU13.29-201ENST00000459370 104 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 CDV3-208ENST00000511392 554 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 OR11H7-201ENST00000553765 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AC018552.3-201ENST00000567416 561 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AL513327.3-201ENST00000602618 469 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AL512782.1-201ENST00000603093 364 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 OR13G1-201ENST00000359688 1046 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 RPL23AP17-201ENST00000401064 499 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AC079922.1-201ENST00000443291 359 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AC074327.1-202ENST00000443523 369 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AC097484.1-201ENST00000471148 389 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 NIPA2P2-201ENST00000496376 1083 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CCDC85BQ15834 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
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