Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 AC099520.1-203ENST00000506976 464 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 AC005351.1-201ENST00000511152 786 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 SEC11B-201ENST00000518383 499 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 LINC02416-201ENST00000550019 540 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 INTS6-AS1-210ENST00000595424 301 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 AC125494.3-201ENST00000602759 455 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 BNIP3P11-201ENST00000603878 563 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 AL392003.1-201ENST00000434394 243 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 RPL37P3-201ENST00000456825 293 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 RPS17P11-201ENST00000474297 293 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 CD200R1-205ENST00000490004 778 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 HIGD1AP18-201ENST00000520730 278 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 AC105999.2-201ENST00000521363 881 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 AC074029.1-201ENST00000552531 1044 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 C15orf65-201ENST00000569691 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 AC090525.3-201ENST00000605601 189 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 PRKCQ-AS1-207ENST00000607996 531 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 DNAJC10-209ENST00000613960 1010 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 AL354950.1-201ENST00000614150 568 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 AL049737.1-201ENST00000413920 1403 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 AL355379.1-201ENST00000405542 640 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 METTL5-205ENST00000409837 936 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 AC112204.2-201ENST00000503269 374 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 RNU6-1308P-201ENST00000516817 103 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 AF117829.1-209ENST00000523995 767 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 MS4A1-205ENST00000528313 928 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 AC036103.1-201ENST00000563846 823 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 C8orf89-203ENST00000625134 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 AC087565.3-202ENST00000642085 1603 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.93
TAF1AQ15573 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 MGST1-201ENST00000010404 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 OR8K1-201ENST00000279783 1087 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 RNU6-244P-201ENST00000391028 104 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 MGST1-203ENST00000396207 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 GSTA12P-201ENST00000402398 508 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 AL024507.1-201ENST00000412741 274 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TAF1AQ15573 AC007161.1-201ENST00000418534 1061 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.5 ms