Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 RNU6-636P-201ENST00000384598 107 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 MIR513B-201ENST00000385136 84 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 ATP5F1P3-201ENST00000397213 657 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 SKINT1L-201ENST00000401057 817 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 RPL31P52-201ENST00000407532 367 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 AC073071.1-201ENST00000412410 388 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
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SIX1Q15475 LINC00382-201ENST00000427918 890 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 Z73417.1-201ENST00000447373 778 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 AC005410.1-202ENST00000460347 485 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 AC010468.1-201ENST00000461022 817 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 IL7R-204ENST00000506850 1004 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 PKIA-AS1-203ENST00000522807 692 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 AF279873.1-201ENST00000523393 313 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 RGS4-207ENST00000527809 817 ntTSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 AP002989.1-201ENST00000533459 562 ntTSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
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SIX1Q15475 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
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SIX1Q15475 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 AC016877.3-201ENST00000606778 504 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 AL022238.2-202ENST00000607915 658 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 AP006248.2-201ENST00000623309 592 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
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SIX1Q15475 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 RNU6-1242P-201ENST00000391052 103 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
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SIX1Q15475 RPL7P15-201ENST00000461190 712 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 AC126121.1-201ENST00000482313 553 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 LINC02049-201ENST00000490647 747 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 RHOBTB3-204ENST00000504179 883 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 TMEM68-206ENST00000519784 1009 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 AC090802.1-201ENST00000520870 445 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 SMARCE1P4-201ENST00000523647 241 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 OR4C2P-201ENST00000530855 1064 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 AC022240.1-201ENST00000532065 684 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 LINC02294-201ENST00000549330 497 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SIX1Q15475 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
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