Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 Z77249.1-201ENST00000444622 1175 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 AL627224.1-201ENST00000448334 444 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 LNX1-AS2-201ENST00000502410 347 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 DSTNP2-201ENST00000504533 515 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 AC022367.1-202ENST00000535066 537 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 LYZ-203ENST00000549690 669 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 AC087463.4-202ENST00000566676 579 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 CXXC1P1-203ENST00000589302 746 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 YWHAQP7-201ENST00000603536 658 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 GTF2H2B-203ENST00000508065 1432 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 PHF11-215ENST00000488958 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 HSFY4P-201ENST00000415994 1181 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 KRR1P1-201ENST00000419430 803 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 RPL34P26-201ENST00000445636 354 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 DUXAP2-201ENST00000519198 589 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 AC104115.2-201ENST00000523026 687 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 LINC02520-201ENST00000570443 537 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
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SYCP1Q15431 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 AC009303.3-201ENST00000591103 736 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 GXYLT1P5-202ENST00000618830 589 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SYCP1Q15431 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 RNU6-670P-201ENST00000364312 104 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 AL160175.1-201ENST00000428124 247 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
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SYCP1Q15431 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
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SYCP1Q15431 LINC02505-203ENST00000515128 756 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
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SYCP1Q15431 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
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SYCP1Q15431 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 HSPE1-MOB4-201ENST00000604458 890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 AC135803.1-201ENST00000608748 565 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 AL590240.3-201ENST00000621416 943 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 AC234772.1-201ENST00000377927 937 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SYCP1Q15431 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
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