Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 AC020914.4-201ENST00000597690 277 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 AC115286.1-201ENST00000604298 434 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 Z98200.1-201ENST00000607298 470 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 API5-210ENST00000534600 1760 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 C12orf50-203ENST00000550553 1525 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 TEX30-204ENST00000376027 1106 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 AC068599.1-201ENST00000422558 567 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 DIAPH3-AS2-201ENST00000428656 367 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 AC092324.1-201ENST00000468671 324 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 AC008802.1-201ENST00000519121 791 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 SDCBP-207ENST00000520168 1097 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 AC011611.4-201ENST00000547721 779 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 AC137768.1-201ENST00000549998 553 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 LINC02290-201ENST00000554187 608 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 AC026992.1-202ENST00000558454 421 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 AC141257.3-201ENST00000572906 215 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 AL512782.1-201ENST00000603093 364 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 AL133338.2-201ENST00000604292 736 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 AL031985.3-201ENST00000565390 2449 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 GABRB2-203ENST00000393959 7191 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 OR9H1P-201ENST00000446393 4888 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 XCL1-201ENST00000367818 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 AC010928.1-201ENST00000592477 1447 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 USP50-205ENST00000616326 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 OR51F2-201ENST00000322110 993 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 OR5H2-202ENST00000356526 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 REG1CP-203ENST00000434852 460 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AC073284.1-201ENST00000448086 404 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 RPL5P32-201ENST00000454085 879 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AC017015.1-201ENST00000477387 286 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 F11-205ENST00000492972 1204 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AC146944.2-203ENST00000502493 354 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AC139495.1-202ENST00000513164 354 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 MRPS33P3-201ENST00000513456 322 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
BRD3Q15059 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.6 ms