Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 AC005695.2-201ENST00000579641 259 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 ELL2P4-201ENST00000446870 1376 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 AC007342.7-201ENST00000624610 2337 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 XKRY2-201ENST00000442362 1093 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 MTND2P30-201ENST00000456663 382 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 AC093663.2-201ENST00000484625 313 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 HMGB1P47-201ENST00000511281 589 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 AC067904.2-201ENST00000517322 1283 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 AC016526.2-201ENST00000554225 520 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 MIR1264-201ENST00000616374 69 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 AC106730.3-201ENST00000624568 641 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
CHD4Q14839 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.8
CHD4Q14839 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CHD4Q14839 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CHD4Q14839 AMD1P2-201ENST00000412936 992 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CHD4Q14839 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CHD4Q14839 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CHD4Q14839 AC104781.1-201ENST00000449838 397 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CHD4Q14839 GIN1-203ENST00000508629 1040 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
CHD4Q14839 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
CHD4Q14839 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
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CHD4Q14839 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CHD4Q14839 AL137072.1-201ENST00000603444 466 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
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CHD4Q14839 AC092184.1-201ENST00000625042 715 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CHD4Q14839 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
CHD4Q14839 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
CHD4Q14839 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CHD4Q14839 ZNF682-209ENST00000597972 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
CHD4Q14839 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
CHD4Q14839 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
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CHD4Q14839 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
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CHD4Q14839 AP000943.4-201ENST00000622912 357 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
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CHD4Q14839 MTND4P10-201ENST00000446199 1363 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CHD4Q14839 AL512283.1-201ENST00000606756 1384 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CHD4Q14839 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CHD4Q14839 PPP1R9A-208ENST00000456331 10090 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CHD4Q14839 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CHD4Q14839 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CHD4Q14839 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CHD4Q14839 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CHD4Q14839 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CHD4Q14839 RPL17P35-201ENST00000432217 549 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CHD4Q14839 IQCG-204ENST00000453254 1230 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CHD4Q14839 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CHD4Q14839 AC018797.3-201ENST00000513388 1241 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CHD4Q14839 AC106791.1-201ENST00000514616 827 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
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