Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 AF181450.1-201ENST00000522980 410 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 AC074029.1-201ENST00000552531 1044 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 AF230666.2-201ENST00000602328 725 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 MMP13-203ENST00000615555 1152 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 AC025750.1-201ENST00000399891 379 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 UBE2V1P6-201ENST00000430840 422 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 AC122718.1-201ENST00000439448 744 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 LRRC69-202ENST00000448384 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 SBDSP1-204ENST00000453858 737 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 LINC01158-205ENST00000458253 747 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 SYPL1P1-201ENST00000473622 768 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 AC092834.1-201ENST00000506514 442 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 C1GALT1P2-201ENST00000510813 1104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 AP001646.3-201ENST00000526305 446 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 AC023442.2-201ENST00000526455 270 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 AP000873.2-205ENST00000529031 435 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 AC007527.1-201ENST00000535528 313 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 TIMM9-206ENST00000555593 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 AC097467.3-204ENST00000595229 827 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 AL034549.1-201ENST00000615120 578 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 AC020923.1-201ENST00000624021 917 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 PPP1R42-201ENST00000324682 1084 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 MIR937-201ENST00000401271 86 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 Z77249.1-201ENST00000444622 1175 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 AL161912.1-201ENST00000448475 524 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 AL589963.1-201ENST00000449282 727 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 AC092112.1-201ENST00000538329 640 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 AC073487.1-201ENST00000547009 529 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 AC245036.5-201ENST00000596330 847 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 AL049737.1-201ENST00000413920 1403 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 PSG6-202ENST00000292125 1391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 PHF11-215ENST00000488958 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 LINC00845-201ENST00000417931 696 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SMCO1Q147U7 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
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