Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 NPM1P41-201ENST00000512920 831 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 MIR3691-201ENST00000578066 90 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 AC090312.1-201ENST00000580637 348 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 TOP2B-201ENST00000264331 5358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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SSPNQ14714 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 ARL4A-204ENST00000396664 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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SSPNQ14714 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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SSPNQ14714 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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SSPNQ14714 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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SSPNQ14714 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 ARL1-211ENST00000551828 776 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 MIR4646-201ENST00000580775 63 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SSPNQ14714 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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